Tak jako v prvním díle i ve dvojce budete řešit tajné úkoly, kterými vyřešíte většinu podmořských záhad v roli tajných rybích agentů. Příběh se Vám ve hře bude prezentovat rozhovory obou rybek, které jsou vtipné a rozhodně Vás rozesmějí. Dalším důležitým prvkem jsou renderované sekvence, která se objeví vždy po určité části hry.

Ovládáte dvě ryby, které musíte použít k přestavění objektů v dané úrovni takovým způsobem, aby mohly ryby bez újmy odplout. Jedna z ryb je větší a může hýbat dokonce i těžkými ocelovými objekty, zatímco ta druhá je menší a může vniknout do děr a chodeb, které jsou pro většího partnera příliš úzké. Později ve hře se k vašemu týmu přidají další milá stvoření; Budete se setkávat s novými zajímavými herními mechanismy a vyzývavými překážkami. Těchto stvoření bude celkem šest a takový veselí krabík, tomu jen tak těžký předmět neublíží. A samozřejmě s pomocí malých podmořských stvoření podíváte nad hladinu vody tam, kam by se Vaši rybí agenti nikdy nedostali. Ve hře si můžete zahrát tutoriál a procvičit tak ovládaní hry. Pro hráče jedničky je ovládaní intuitivní, ale i pro nové hráče to není nic složitého a po pár kolech pochopí vše.