Hra se dočkala vylepšení prakticky ve všech oblastech. Zásadní rozšíření a doplnění obsahuje 3D mód, modely financí, přestupů či kalendář. Změny v 3D módu zaručují mnohem realističtější zážitek ze hry, obsahují novou logiku a umělou inteligenci hráčů; lépe vypadají i možnosti nastavení taktiky, střídání hráčů či počínání trenérů soupeře.

Nové intuitivní uživatelské rozhraní umožňuje získat relevantní informace k aktuálnímu dění v zápasu v horizontu sekund a vydávat přesné taktické pokyny. FIFA Manager 12 rovněž obsahuje celou řadu vylepšení onlinových režimů, přičemž všechny prémiové funkce z loňské edice jsou nyní přístupné úplně každému. Vylepšení se konkrétně týkají dokonalejšího editoru avatara, možnosti tvorby fantasy lig a pestré škály nových statistik.